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從頭測(cè)序 是一種分析和鑒定肽序列和一些翻譯后修飾蛋白的方法。 與其他一些分析方法依賴于已知的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)或已知的質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫(kù)不同，de novo 測(cè)序使用串聯(lián)質(zhì)譜法根據(jù)肽段的斷裂特征進(jìn)行直接分析。 因此，蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中未包含的肽序列、新物種的蛋白質(zhì)序列和基因組尚未測(cè)序的蛋白質(zhì)序列都可以進(jìn)行分析。 該方法開發(fā)的軟件包括 PepNovo、PEAKS 和 pNovo。
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輝駿生物-蛋白質(zhì)磷酸化對(duì)于調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)定位和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用至關(guān)重要，這些相互作用構(gòu)成了許多細(xì)胞信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)。 基于磷酸化的信號(hào)傳導(dǎo)通常采用級(jí)聯(lián)的形式，其中連續(xù)的蛋白質(zhì)磷酸化導(dǎo)致蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、功能和定位的變化。
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輝駿生物-提供His標(biāo)簽蛋白表達(dá)但不結(jié)合Ni-NTA色譜柱方法如下，可以從以下3點(diǎn)著手：1.您的增溶緩沖液是否需要優(yōu)化？2.您的親和樹脂新鮮有效嗎？ 3.您的蛋白質(zhì)是否隱藏了組氨酸標(biāo)簽？
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自下而上和自上而下是兩種基于生物量光譜法的蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法。 自下而上，也稱為霰彈槍，是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中廣泛使用的質(zhì)譜技術(shù)，是一種將大蛋白質(zhì)片段消化/酶促溶解成小肽進(jìn)行分析的傳統(tǒng)方法。 自上而下可以直接對(duì)完整蛋白質(zhì)進(jìn)行測(cè)序，包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大片段蛋白質(zhì)，而不僅僅是肽。
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有些物種的數(shù)據(jù)庫(kù)質(zhì)量不好，包含的蛋白數(shù)目過(guò)少，這種可以考慮換大一級(jí)的物種分類數(shù)據(jù)庫(kù)，或者選擇在進(jìn)化樹上同源性較近的、研究比較清楚的、基因組數(shù)據(jù)庫(kù)相對(duì)完整的模式物種的數(shù)據(jù)庫(kù)重新查庫(kù)。
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PCR反應(yīng)條件的選擇技巧主要體現(xiàn)在溫度、時(shí)間和循環(huán)次數(shù)上，溫度過(guò)高，延伸時(shí)間不夠都會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果有很大的影響，輝駿生物總結(jié)了以下幾點(diǎn)關(guān)于PCR反應(yīng)條件的選擇技巧及優(yōu)化方法。
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選擇“正確”標(biāo)簽可能是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)。理想的標(biāo)簽將幫助你獲得可溶性蛋白，簡(jiǎn)化你的純化方案，并且不會(huì)干擾下游應(yīng)用。
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還是分不清IP，Co-IP，GST pull down？輝駿生物在下文除了介紹介紹IP與Co-IP區(qū)別知識(shí)要點(diǎn)，也將研究蛋白互作幾種方法（酵母雙雜交系統(tǒng)（Y2H），CO-IP的關(guān)系，GST-Pull Down）之間的區(qū)別以及優(yōu)缺點(diǎn)簡(jiǎn)明扼要的收納進(jìn)來(lái)。
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定量PCR中有一個(gè)很重要的概念—Ct值.那么Ct值究竟是什么呢，輝駿生物來(lái)給大家講一講。
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雙向電泳一次可以從細(xì)胞、組織或其它生物樣本中分離上千種蛋白質(zhì)，凝膠上的斑點(diǎn)都對(duì)應(yīng)著樣品中的蛋白質(zhì)，且各種蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)，分子量和含量的信息都能通過(guò)質(zhì)譜鑒定和軟件分析獲得。
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在磁珠法核酸提取的過(guò)程中，樣本的前處理工作對(duì)整個(gè)提取結(jié)果會(huì)有至關(guān)重要的影響。當(dāng)然，選取合適的磁珠，更能使提取結(jié)果事半功倍，吉恩特生物的01系列磁珠，半沉降時(shí)間可達(dá)15min以上，磁吸時(shí)間僅為15s左右，可為操作者帶來(lái)不一樣的磁珠操作體驗(yàn)。
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單細(xì)胞基因組測(cè)序目前主要有兩種擴(kuò)增方法：MALBAC方法及MDA方法，而單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組目前主要有三種方法：SMART擴(kuò)增技術(shù)、10×genomics技術(shù)及Andeplete技術(shù)。今天主要和大家比較下單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的三種常用方法。
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