PRM靶向定量蛋白檢測 * 實驗原理

PRM（平行反應(yīng)監(jiān)視，parallel reaction monitoring）是目前靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)的主流方法之一。利用四級桿質(zhì)量分析器選擇性的檢測目標(biāo)肽段的母離子信息，隨后在HCD碰撞池中發(fā)碎裂，最后進入高分辨率、高質(zhì)量精度的Orbitrap分析器中，檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片離子信息，這樣即可對復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白/肽段進行特異性的定量分析。

PRM靶向定量蛋白檢測 * 檢測流程

PRM靶向定量蛋白檢測 * 技術(shù)應(yīng)用

1、驗證高通量定量蛋白質(zhì)組學(xué)（如iTRAQ、TMT、SILAC、Label free）的實驗結(jié)果
2、對目標(biāo)蛋白質(zhì)相對或絕對定量分析

PRM靶向定量蛋白檢測 * 輝駿服務(wù)優(yōu)勢

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十年服務(wù)經(jīng)驗，客戶成果發(fā)表在NatureMethods，Oncogene，Cell Research等高水平期刊上。

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對蛋白篩選與定量方面有獨到見解，擅長針對客戶情況提出合適的方案建議。

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自有分子及細胞生物實驗平臺，能有效制定并執(zhí)行最優(yōu)的實驗路線。

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售后技術(shù)支持將一直保持到客戶發(fā)表文章，確?？蛻舭残倪M行下游實驗及投稿。

聯(lián)系技術(shù)支持

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PRM靶向定量蛋白檢測 * 服務(wù)信息

PRM靶向定量蛋白檢測 * 客戶文獻

1. Lisa H.et al: Development of a Parallel Reaction Monitoring Mass Spectrometry Assay for the Detection of SARS-CoV?2 Spike Glycoprotein and Nucleoprotein.Analytical Chemistry.2018，IF=4.402. 【研究內(nèi)容】：研究者采用數(shù)據(jù)獨立采集(DIA)定量質(zhì)譜法對20例接受培美曲塞/鉑類化療的晚期肺腺癌患者的血清標(biāo)本進行分析，并使用平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)方法檢測了20例患者和22例晚期肺腺癌患者的16個候選血清標(biāo)志物。研究證實了DIA、MS和PRM相結(jié)合的方法在識別晚期肺腺癌患者的血清預(yù)測生物標(biāo)志物方面是有效的。 使用技術(shù)：蛋白組學(xué)prm實驗檢測、PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)、蛋白組 prm外包公司

2. Clara I.et al: Ethylene Receptors, CTRs and EIN2 Target Protein Identification and Quantification Through Parallel Reaction Monitoring During Tomato Fruit Ripening.Front. Plant Sci.2020，IF=6.785. 【研究內(nèi)容】：研究者為乙烯受體(ETR)及其下游組分CTR和EIN2的鑒定和定量，開發(fā)了一套包括樣品分離和平行反應(yīng)監(jiān)測結(jié)合質(zhì)譜分析（PRM-MS）的研究方案。以番茄為模式果實，研究了果實成熟過程中乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)蛋白豐度的變化。研究證實了鑒定和絕對定量番茄四個成熟階段的七個乙烯受體、四分之三的CTR和EIN2的可行性。 使用技術(shù)：蛋白PRM定量技術(shù)服務(wù)、平行反應(yīng)監(jiān)測技術(shù)PRM、蛋白定量prm代做

蛋白組/代謝組實驗

? iTRAQ 定量蛋白質(zhì)組學(xué)

? Label Free 實驗檢測服務(wù)

? LC-MS/MS 蛋白質(zhì)譜鑒定

? DIA 全息掃描定量蛋白質(zhì)
? 廣泛靶向代謝組學(xué)

蛋白/核酸相互作用實驗

? GST pull down

? RNA pull down

? DNA pull down

? Co-IP 免疫共沉淀

? TAP-MS串聯(lián)親和純化

分子細胞生物學(xué)實驗

? 基因調(diào)取/合成 (cDNA克隆)

?熒光定量PCR (qPCR)

? 載體構(gòu)建實驗服務(wù)

?miRNA靶基因驗證
? 慢病毒包裝

科研產(chǎn)品

? 哺乳動物細胞表達載體

? 人cDNA克隆庫

? 慢病毒表達載體

? 慢病毒干擾載體

抗體工程服務(wù)

? 單克隆抗體測序

? 抗體從頭測序

? 抗體表達服務(wù)

? 重組抗體表達

實驗試劑盒

? RNA pull down 試劑盒

? GST pull down 試劑盒

? COIP 試劑盒

? Flag 試劑盒

輝駿實力

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中文標(biāo)題：靶向蛋白質(zhì)組學(xué)在子宮內(nèi)膜癌液體活檢診斷中的作用

發(fā)表期刊：Clinical Cancer Res

影響因子：12.531

運用技術(shù)：PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)（由輝駿生物提供技術(shù)支持）

● 內(nèi)容概述

子宮內(nèi)膜癌(EC)的診斷依賴于通過抽吸獲得的子宮內(nèi)膜活檢組織(即子宮抽吸物)中腫瘤細胞的觀察，漏檢率達22%，50%的EC組織分型和級別被錯診?；谶@種現(xiàn)狀，本研究意圖通過液體活檢檢測蛋白標(biāo)志物的方式得到一種更加準(zhǔn)確的診斷方式。通過最新一代的靶向質(zhì)譜采集技術(shù)LC-PRM對子宮吸出液體的52個蛋白含量進行測定，在EC組和對照組以及EC壓型組運用邏輯回歸模型對數(shù)據(jù)進行處理，處理結(jié)果顯示MMP9和KPYM兩種蛋白組合能夠有效診斷EC AUC值為0.96，CTNB1、XPO2和CAPG聯(lián)合檢測能夠有效區(qū)分各壓型，AUC值為0.99。該研究為臨床診斷提供了非常好的候選標(biāo)志物。

● 方法流程

本研究遵循的一般工作流程如圖所示。116例患者的子宮抽吸液處理一式兩份，并在混合四極軌道質(zhì)譜儀上進行PRM采集分析。

在每個樣本中，先前研究(15)中優(yōu)先考慮的52個候選生物標(biāo)記物的相對豐度是通過對98個肽的分析來測量的。計算光譜相似性分數(shù)以確認多肽的同一性并檢測MS信號中的干擾。超過50%的樣本中沒有檢測到的五個肽被移除，導(dǎo)致總共有51個蛋白質(zhì)被93個肽測量出來。通過重復(fù)樣品制備來評價分析流程的重復(fù)性，98%的檢測多肽的變異系數(shù)(CV%)低于15%，平均為3.6%。此外，來自同一蛋白質(zhì)的多肽顯示出高度的相關(guān)性，因此，它們可以互換使用來評估蛋白質(zhì)水平。只有三種蛋白(KPYM、OSTP和ROA2)的相關(guān)系數(shù)低于0.85，因為它們是由異構(gòu)體特異性多肽監(jiān)測的。這些多肽被認為來自不同的蛋白質(zhì)。

引用文獻

Elena Martinez-Garcia. et al: Targeted Proteomics Identifies Proteomic Signatures in Liquid Biopsies of the Endometrium to Diagnose Endometrial Cancer and Assist in the Prediction of the Optimal Surgical Treatment. Cancer Res.  2017，IF=12.531.