結(jié)合了抗體的磁珠或樹(shù)脂(Beads)與樣本裂解液孵育,通過(guò)”抗原-抗體“之間的免疫作用,誘餌蛋白被吸附在Beads上,與此同時(shí),誘餌蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗滌去掉未結(jié)合的蛋白后,再用洗脫緩沖液將互作蛋白復(fù)合物從Beads上洗脫下來(lái),得到免疫共沉淀(Co-IP)產(chǎn)物。Co-IP產(chǎn)物既可以用Western Blot檢測(cè)已知蛋白,也可以用質(zhì)譜鑒定未知蛋白。
當(dāng)沒(méi)有合適的誘餌蛋白抗體時(shí),還可以通過(guò)表達(dá)融合了Flag標(biāo)簽的誘餌蛋白,利用Flag標(biāo)簽抗體做免疫沉淀。即樣本過(guò)表達(dá)Flag-Bait,經(jīng)裂解后與anti-Flag珠子孵育,誘餌融合蛋白與Beads結(jié)合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再經(jīng)洗滌、洗脫后,用WB或質(zhì)譜檢測(cè)。
輝駿生物10年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),專(zhuān)業(yè)提供分子互作實(shí)驗(yàn)服務(wù),包括蛋白與蛋白、蛋白與DNA、蛋白與RNA、RNA與RNA的相互作用技術(shù),經(jīng)驗(yàn)豐富,實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定、可靠。
我公司自有分子、細(xì)胞和質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)平臺(tái),能執(zhí)行最優(yōu)的實(shí)驗(yàn)路線(xiàn),對(duì)微量互作蛋白的質(zhì)譜鑒定有充足把控力,對(duì)后續(xù)功能分析有獨(dú)到見(jiàn)解。
我們不僅會(huì)提供專(zhuān)業(yè)的售前方案建議、而且售后技術(shù)支持將一直保持到文章發(fā)表,確保您安心進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)及投稿。
目前,客戶(hù)已在Nature子刊、Oncogene、Cell Research等高水平期刊成功發(fā)表大量高分文章(點(diǎn)擊查看客戶(hù)文獻(xiàn))。
內(nèi)源蛋白抗體免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)步驟
標(biāo)簽抗體免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)流程
蛋白質(zhì)之間相互作用是其發(fā)揮生物學(xué)功能的主要模式,蛋白質(zhì)會(huì)通過(guò)結(jié)合不同的伙伴來(lái)行駛不同的功能,形成復(fù)雜的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)。常見(jiàn)的蛋白互作研究方法主要有:免疫共沉淀(Co-IP)、pull down、酵母雙雜交、熒光雙分子互補(bǔ)(BiFC)、熒光共定位等。這些方法相互補(bǔ)充,通過(guò)多種方法共同驗(yàn)證蛋白質(zhì)間的相互作用,能更大程度的避免假陽(yáng)性結(jié)果。
Co-IP技術(shù)采用抗體捕獲樣本中的目標(biāo)蛋白及其互作蛋白復(fù)合物,反應(yīng)的是體內(nèi)真實(shí)的生理結(jié)合,但不能顯示這些相互作用是直接還是間接的;另外合適的免疫共沉淀抗體是決定實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵,有些蛋白沒(méi)有合適的IP抗體,無(wú)法進(jìn)行內(nèi)源性Co-IP實(shí)驗(yàn);通過(guò)構(gòu)建帶標(biāo)簽的表達(dá)載體,使目標(biāo)蛋白與標(biāo)簽融合表達(dá),再借助標(biāo)簽抗體即可完成Co-IP實(shí)驗(yàn),但需要注意合適的轉(zhuǎn)基因方法又是影響該方法成功的關(guān)鍵。
pull down技術(shù)將目標(biāo)蛋白進(jìn)行體外原核表達(dá),使標(biāo)簽蛋白(GST或His等)與目標(biāo)蛋白融合表達(dá),借助標(biāo)簽的親和介質(zhì)將目標(biāo)蛋白純化出來(lái),可以不受抗體、物種限制,比較輕松的獲得目標(biāo)蛋白的結(jié)合蛋白,還可以通過(guò)外源同時(shí)表達(dá)目標(biāo)蛋白和待測(cè)蛋白,確定它們是否發(fā)生直接的相互作用,但該方法無(wú)法得知體內(nèi)真實(shí)的結(jié)合情況。
酵母雙雜交技術(shù)是比較古老的一種技術(shù),將目標(biāo)蛋白和待測(cè)蛋白與GAL4 的兩個(gè)結(jié)構(gòu)域BD和AD融合表達(dá),在酵母細(xì)胞中,2個(gè)蛋白的結(jié)合使得BD和AD在空間上靠近,從而激活報(bào)告基因lacZ的表達(dá)。但是由于受試蛋白都需要和 AD/BD 結(jié)構(gòu)域形成融合蛋白,空間構(gòu)象可能改變;另外假陽(yáng)性率也比較高。
熒光雙分子互補(bǔ)(BiFC)技術(shù)將目標(biāo)蛋白和待測(cè)蛋白分別與GFP的兩個(gè)片段融合表達(dá),轉(zhuǎn)染細(xì)胞后,2個(gè)蛋白的結(jié)合使得GFP兩個(gè)片段空間上靠近,從而發(fā)出綠色熒光,該技術(shù)觀測(cè)直觀,操作簡(jiǎn)便,但空間分辨率大約 250nm,對(duì)于蛋白質(zhì)相互作用來(lái)說(shuō)依然是個(gè)相當(dāng)遠(yuǎn)的距離,因此位置上靠近但并未結(jié)合的蛋白也可能顯示陽(yáng)性結(jié)果,假陽(yáng)性率較高;另外該技術(shù)可以驗(yàn)證蛋白間的相互作用,但不能篩選未知互作蛋白。
熒光共定位技術(shù)依靠熒光確定蛋白質(zhì)具有相同定位,用于輔助證明而非直接證明細(xì)胞內(nèi)蛋白間的相互作用。
服務(wù)項(xiàng)目 | 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實(shí)驗(yàn)周期 | 客戶(hù)提供 | 價(jià)格 |
Co-IP WB (驗(yàn)證型) | 樣本質(zhì)檢 (Western blot檢測(cè)誘餌蛋白和待測(cè)蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖 樣本的待測(cè)蛋白Western blot檢測(cè)圖 | 3-4周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 待測(cè)蛋白抗體 實(shí)驗(yàn)信息表 | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | IP產(chǎn)物的誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖 IP產(chǎn)物的待測(cè)蛋白Western blot檢測(cè)圖 CoIP實(shí)驗(yàn)報(bào)告 | ||||
Co-IP MS (篩選型) | 樣本質(zhì)檢(Western blot檢測(cè)誘餌蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖 | 6-7周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 實(shí)驗(yàn)信息表 | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | IP產(chǎn)物的誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖 CoIP實(shí)驗(yàn)服務(wù)報(bào)告 | ||||
IP產(chǎn)物的質(zhì)譜檢測(cè)及數(shù)據(jù)分析 | 質(zhì)譜(LC-MS/MS)檢測(cè)結(jié)果及報(bào)告 互作蛋白篩選表格 生物信息學(xué)分析結(jié)果和報(bào)告 |
樣本類(lèi)型 | COIP-WB 建議送樣量 | COIP-MS 建議送樣量 |
動(dòng)物細(xì)胞 | 3*10e7個(gè)細(xì)胞/組(約3個(gè)10cm皿) | 5*10e7個(gè)細(xì)胞/組(約5個(gè)10cm皿) |
動(dòng)物組織 | 1g/組 | 2g/組 |
植物葉片 | 2g/組 | 4g/組 |
植物根或果實(shí) | 4g/組 | 8g/組 |
菌體 | 50ul菌體沉淀/組 | 100ul菌體沉淀/組 |
▲注意:這里列出的均為每組樣本的送樣量,如果實(shí)驗(yàn)和對(duì)照組用的樣本一致,此樣本量*2。詳細(xì)送樣指南可聯(lián)系輝駿生物客服或銷(xiāo)售索取。
保存及運(yùn)輸:-80℃保存,干冰取樣/運(yùn)輸,至少在送樣前2天通知我司。
Co-IP WB:誘餌蛋白和待測(cè)蛋白Western blot檢測(cè)圖(陽(yáng)性)
Co-IP MS:誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖
Co-IP MS:質(zhì)譜檢索表格(部分展示)
Co-IP MS:互作蛋白生信分析結(jié)果(部分展示)
Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP.
Cancer Research. 2019. (中科院1區(qū),IF=13.312).
轉(zhuǎn)移性前列腺癌具有很高的致命性。已有報(bào)道表明,膽固醇與前列腺癌的發(fā)展有關(guān);前期研究發(fā)現(xiàn),膽固醇可以誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),但其作用及潛在機(jī)制尚不清楚。本研究證明膽固醇介導(dǎo)APMAP上調(diào),APMAP通過(guò)與EGFR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合EPS15R,進(jìn)而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞EMT;提出APMAP可能是一種關(guān)鍵的調(diào)節(jié)劑,為高脂肪飲食、肥胖和癌癥轉(zhuǎn)移之間提供了聯(lián)系。
1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352. |
2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312. |
3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067. |
1. Co-IP WB,用于檢測(cè)某樣本中的誘餌蛋白和待測(cè)蛋白是否存在相互作用;
2. Co-IP MS,用于篩選某樣本中的誘餌蛋白與哪些蛋白具有相互作用。
Co-IP(免疫共沉淀)檢測(cè)服務(wù) | |||||
服務(wù)項(xiàng)目 | 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實(shí)驗(yàn)周期 | 客戶(hù)提供 | 價(jià)格 |
Co-IP WB | Western blot檢測(cè)樣本(input)中的誘餌蛋白和待測(cè)蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | 3-4周 | 1、實(shí)驗(yàn)樣本 2、誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 3、待測(cè)蛋白抗體 4、實(shí)驗(yàn)信息表(樣本信息、抗體信息、誘餌蛋白和待測(cè)蛋白序列) | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | CoIP實(shí)驗(yàn)報(bào)告 | ||||
Western blot檢測(cè)Co-IP產(chǎn)物中的誘餌蛋白和待測(cè)蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | ||||
Co-IP MS | Western blot檢測(cè)樣本(input)中的誘餌蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | 5-6周 | 1、實(shí)驗(yàn)樣本 2、誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 3、實(shí)驗(yàn)信息表(樣本信息、抗體信息、誘餌蛋白序列) | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | CoIP實(shí)驗(yàn)服務(wù)報(bào)告 | ||||
Western blot檢測(cè)Co-IP產(chǎn)物中的誘餌蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | ||||
LC-MS/MS定性檢測(cè)Co-IP產(chǎn)物的蛋白、篩選實(shí)驗(yàn)組獨(dú)有蛋白(潛在互作蛋白) | 質(zhì)譜檢索表格、互作蛋白篩選表格、檢測(cè)報(bào)告 | ||||
針對(duì)互作蛋白做生物信息學(xué)分析(GO、KEGG pathway、String) | 生物信息學(xué)分析結(jié)果和報(bào)告 | 1周 |
1. 送樣量要求
樣本類(lèi)型 | Co-IP WB 建議送樣量 | Co-IP MS 建議送樣量 |
動(dòng)物細(xì)胞 | 3*10e7個(gè)細(xì)胞/組(約3個(gè)10cm皿) | 5*10e7個(gè)細(xì)胞/組(約5個(gè)10cm皿) |
動(dòng)物組織 | 1g/組 | 2g/組 |
植物葉片 | 2g/組 | 4g/組 |
植物根或果實(shí) | 4g/組 | 8g/組 |
菌體 | 50ul菌體沉淀/組 | 100ul菌體沉淀/組 |
▲注意:這里列出的均為每組樣本的送樣量,如果實(shí)驗(yàn)和對(duì)照組用的樣本一致,此樣本量*2。詳細(xì)送樣指南可聯(lián)系輝駿生物客服或銷(xiāo)售索取。
(1)樣本用PBS清洗干凈后,離心去掉液體,先放入液氮中速凍,再轉(zhuǎn)移至-80℃冰箱中保存;
(2)樣本一定要做好標(biāo)記,應(yīng)用油性防凍記號(hào)筆或標(biāo)簽紙?jiān)诠苌献⒚鳂颖久Q(chēng)或編號(hào);
(3)樣本較多或需要分批做,要將樣本分裝;
(4)干冰取樣/運(yùn)輸;需要至少在送樣前一天通知我方。
Co-IP WB:誘餌蛋白和待測(cè)蛋白Western blot檢測(cè)圖(陽(yáng)性)
Co-IP MS:誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖
Co-IP MS:質(zhì)譜檢索表格(部分展示)
1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352. |
2. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312. |
3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067. |
4899+客戶(hù)已添加微信獲取實(shí)驗(yàn)優(yōu)惠!
名稱(chēng) | 貨號(hào) | 規(guī)格 | 貨期 | 價(jià)格 |
動(dòng)物Co-IP試劑盒(protein A/G磁珠) | FI8802 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 | |
動(dòng)物Co-IP試劑盒(protein G樹(shù)脂) | FI8803 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 | |
植物Co-IP試劑盒(protein A/G磁珠) | FI8812 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 | |
植物Co-IP試劑盒(protein G樹(shù)脂) | FI8813 | 20次/40次 | 現(xiàn)貨 |
輝駿生物的免疫共沉淀試劑盒能夠高效完成抗原的免疫沉淀(IP)及免疫共沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)。首先,將特異性的抗體加入樣品中與目標(biāo)抗原形成免疫復(fù)合物,然后將其結(jié)合在protein G或protein A/G beads上。通過(guò)漂洗去除未結(jié)合物質(zhì)后,用低 pH 的洗脫液將免疫復(fù)合物從beads上洗脫下來(lái)。洗脫的蛋白產(chǎn)物既可以用Western blot檢測(cè)已知蛋白,也可以用質(zhì)譜(LC-MS/MS)鑒定未知蛋白。
蛋白-蛋白間的相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮生物學(xué)功能的主要模式。CO-IP試劑盒采用Protein G或Protein A/G beads來(lái)捕獲目標(biāo)蛋白抗體,進(jìn)而捕獲樣本中天然結(jié)合的目標(biāo)蛋白及其互作蛋白。以下列舉了可應(yīng)用CO-IP試劑盒的幾個(gè)研究方向:
1. 病毒、細(xì)菌等病原體侵染宿主細(xì)胞的機(jī)制;
2. 酶和底物的作用機(jī)制;
3. 天然狀態(tài)下蛋白調(diào)控復(fù)合體的研究。
試劑名稱(chēng) | 體積(20 Tests) | 體積(40 Tests) | 保存條件 |
Protein G beads或Protein A/G beads | 850 μL | 1.7 mL | 4 ℃ |
裂解緩沖液 | 11 mL | 22 mL | 4 ℃ |
漂洗液 | 40 mL | 80 mL | 4 ℃ |
洗脫緩沖液 | 1.1 mL | 2.2 mL | 4 ℃ |
蛋白酶抑制劑 | 300 μL | 600 μL | -20 ℃ |
2、裂解效率高:不同優(yōu)化的裂解液配方分別適用于動(dòng)物、植物樣本。
3、洗脫液適配后續(xù)Western Blot及質(zhì)譜(LC-MS/MS)實(shí)驗(yàn)。
4、操作簡(jiǎn)便,耗時(shí)短,適用于初學(xué)者。
5、應(yīng)用靈活:可用于任何內(nèi)源性目標(biāo)蛋白的免疫沉淀或免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)。
1. 將細(xì)胞裂解液與所選抗體在室溫下孵育 1-2 小時(shí),或 4 ℃ 過(guò)夜。
2. 在室溫下,將抗原/抗體復(fù)合物與protein G或ProteinA/G beads結(jié)合 1-2 小時(shí)。
3. 漂洗、洗脫得到目標(biāo)蛋白及其互作蛋白復(fù)合物。
1. Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research. 2019. IF= 13.312.
2. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020. IF=12.067.
3. Li T. et al: Phosphorylated ATF1 at Thr184 promotes metastasis and regulates MMP2 expression in gastric cancer. J Transl Med. 2022. IF=8.44.
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