根據(jù)樣品SDS-PAGE圖(注:SDS-PAGE無(wú)過(guò)度染色情況),判斷樣本本身的蛋白質(zhì)豐富程度,蛋白質(zhì)條帶較少或者較淺(含量低)都會(huì)導(dǎo)致鑒定結(jié)果不佳,可考慮增加樣本量再進(jìn)行檢測(cè)。
根據(jù)SDS-PAGE圖判斷樣品中是否存在高豐度蛋白質(zhì),高豐度蛋白質(zhì)會(huì)影響樣本整體蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量。
有些物種的數(shù)據(jù)庫(kù)質(zhì)量不好,包含的蛋白數(shù)目過(guò)少,這種可以考慮換大一級(jí)的物種分類數(shù)據(jù)庫(kù),或者選擇在進(jìn)化樹(shù)上同源性較近的、研究比較清楚的、基因組數(shù)據(jù)庫(kù)相對(duì)完整的模式物種的數(shù)據(jù)庫(kù)重新查庫(kù)。
樣本中有污染或干擾物質(zhì),例如常見(jiàn)的有PEG、各種表面活性劑(如SDS、CHAPS、Triton、Tweens、NP-40等),一般在質(zhì)譜的表現(xiàn)為規(guī)律的分子量間隔約44的峰。
輝駿生物會(huì)根據(jù)TIC、basepeak圖等,判斷酶解、儀器狀態(tài)等是否正常,如果是儀器問(wèn)題導(dǎo)致的鑒定結(jié)果不好,我方會(huì)即刻告知客戶并安排重復(fù)實(shí)驗(yàn)。
輝駿生物10年專注LC-MS/MS蛋白鑒定實(shí)驗(yàn),服務(wù)到投稿,客戶已在Nature methods,Nature Cell Biology,Nature Plants,Nature communication,Annals of the rheumatic diseases,Journal of Hematology & Oncology等高水平期刊成功發(fā)表論文。
LC-MS/MS蛋白鑒定實(shí)驗(yàn)服務(wù)內(nèi)容包含:蛋白酶解、多肽純化、LC-MS/MS檢測(cè),數(shù)據(jù)庫(kù)檢索、蛋白修飾鑒定等項(xiàng)目??梢砸淮涡澡b定成百上千種蛋白質(zhì),準(zhǔn)確性和靈敏度高。實(shí)驗(yàn)熱線:4006991663,歡迎新老客戶前來(lái)咨詢!
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