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蛋白質(zhì)磷酸化實驗原理、主要類型和功能介紹

蛋白質(zhì)磷酸化是指由蛋白激酶催化,將ATP或GTP的γ位磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到底物蛋白的氨基酸殘基(絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸等)上的過程。 蛋白質(zhì)磷酸化是體內(nèi)常見的調(diào)節(jié)方式,在細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中發(fā)揮著重要作用。 幾乎所有的蛋白質(zhì)在合成過程中或合成后都會發(fā)生某種形式的修飾。 異常的翻譯后修飾與疾病的發(fā)生有關(guān)。 某些特定的翻譯后修飾被開發(fā)為疾病的分子標(biāo)記或治療靶點(diǎn)。 最常見和最重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,蛋白質(zhì)磷酸化是將外部刺激轉(zhuǎn)化為細(xì)胞內(nèi)信號的主要機(jī)制。


在磷酸化反應(yīng)中,在蛋白質(zhì)的氨基酸側(cè)鏈上加入一個帶強(qiáng)負(fù)電荷的磷酸基團(tuán),引起酯化作用,從而改變其與其他分子相互作用的構(gòu)型、活性和性能。  酯化調(diào)節(jié)許多生物過程,例如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因表達(dá)和細(xì)胞分裂。  編碼的蛋白質(zhì)只會被特定的氨基酸磷酸化。   在真核生物中,主要被絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸等氨基酸殘基磷酸化。  在細(xì)菌中,殘基如天冬氨酸、谷氨酸和組氨酸磷酸化蛋白質(zhì)。   一些蛋白質(zhì)在原核生物和真核生物中都被磷酸化,它們的磷酸化位點(diǎn)通常是精氨酸、賴氨酸和半胱氨酸殘基。   可逆的蛋白質(zhì)磷酸化調(diào)節(jié)細(xì)胞的大部分功能,如能量儲存、形態(tài)變化、蛋白質(zhì)合成、基因表達(dá)、信號因子釋放、肌肉收縮和生化代謝。   因此,蛋白質(zhì)磷酸化分析和位點(diǎn)鑒定已成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重點(diǎn)之一。


蛋白質(zhì)磷酸化的主要類型和功能

根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同,磷酸化蛋白可分為4類:O-磷酸蛋白、N-磷酸蛋白、?;姿岬鞍缀蚐-磷酸蛋白

1. O-磷酸蛋白是由羥基氨基酸(如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸)磷酸化形成的,但羥基脯氨酸或羥基賴氨酸的磷酸化作用尚不清楚。

2. N-磷酸蛋白由精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。

3. ?;姿岬鞍子商於彼峄蚬劝彼岬牧姿峄纬?。

4. S-磷酸蛋白由半胱氨酸磷酸化形成。


蛋白質(zhì)磷酸化的功能是多種多樣的

1. 參與其他重要的酶促反應(yīng)(磷酸化反應(yīng)產(chǎn)生中間產(chǎn)物,多為S或N磷酸鹽等)

2. 介導(dǎo)蛋白質(zhì)活性(蛋白質(zhì)分子通過蛋白激酶的磷酸化改變性能),例如蛋白激酶 A(磷酸化絲氨酸和蘇氨酸殘基)或各種受體酪氨酸激酶(磷酸化酪氨酸殘基)

3. 發(fā)揮多種獨(dú)特的生理作用。  例如,天冬氨酸、谷氨酸和組氨酸磷酸化蛋白在細(xì)菌趨化反應(yīng)的感覺傳遞中解離。  某些激素也以特定磷酸化蛋白的形式存在于靶組織中。


蛋白質(zhì)磷酸化的研究方法

近年來,更多的研究集中在蛋白質(zhì)磷酸化上。  一些主題包括確定蛋白質(zhì)的位點(diǎn)特異性磷酸化、植物蛋白磷酸化和動物神經(jīng)細(xì)胞磷酸化。  新的研究方法不斷涌現(xiàn)。  最廣泛使用的技術(shù)是質(zhì)譜和同位素標(biāo)記結(jié)合免疫印跡-化學(xué)發(fā)光分析。


質(zhì)譜檢測

質(zhì)譜法是利用電場和磁場,根據(jù)質(zhì)荷比檢測帶電運(yùn)動粒子(包括原子、分子甚至分子結(jié)構(gòu)片段)的物理和化學(xué)性質(zhì)的方法。  核素的精確質(zhì)量是小數(shù)位數(shù)。  任何兩種核素的質(zhì)量都是不同的,一種核素的質(zhì)量并不完全是另一種核素的整數(shù)倍。   因此,通過測量帶電粒子(離子)的精確質(zhì)量,可以確定相應(yīng)的化合物組成、結(jié)構(gòu)和裂化規(guī)律。


與未修飾的多肽相比,磷酸基修飾的多肽的相對分子質(zhì)量增加了79.983。  磷酸肽的產(chǎn)生意味著片段離子結(jié)構(gòu)可用于診斷,這與未修飾的肽不同。  質(zhì)譜法可用于鑒定蛋白質(zhì)磷酸化。   通過使用特定序列水解酶(如胰蛋白酶)水解凝膠分離的蛋白質(zhì),獲得不同的肽。  高效液相色譜用于分離感興趣的肽,然后進(jìn)行質(zhì)譜分析。


同位素標(biāo)記結(jié)合免疫印跡-化學(xué)發(fā)光分析

該方法使用放射性同位素標(biāo)記、 二維電泳 和放射自顯影來建立蛋白質(zhì)組圖。 通過免疫印跡持久化學(xué)發(fā)光可以選擇性地識別和分析目標(biāo)蛋白,也可以用于同時比較多個樣品中相同蛋白的表達(dá)。


當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)被磷酸化時,放射性 32 P的摻入和分子質(zhì)量的變化會引起凝膠位移,這使得免疫印跡在分析檢測中占有重要地位。


當(dāng)化學(xué)反應(yīng)產(chǎn)生的能量以光的形式釋放出來時,稱為化學(xué)發(fā)光。   例如,最常用的化學(xué)發(fā)光試劑之一魯米諾被過氧化物氧化產(chǎn)生氨基鄰苯二甲酸酯。  當(dāng)該產(chǎn)物衰變?yōu)榈湍軕B(tài)時,會釋放出一個光子。   使用獲得專利的添加劑來增加發(fā)光強(qiáng)度和發(fā)光反應(yīng)的持續(xù)時間(穩(wěn)定性),生產(chǎn)了一種增強(qiáng)的化學(xué)發(fā)光 (ECL) 試劑。  在使用 ECL 的免疫印跡中,當(dāng)酶和反應(yīng)底物相互作用時,化學(xué)發(fā)光劑會產(chǎn)生可檢測的光。   特定抗體在適當(dāng)稀釋濃度下產(chǎn)生的穩(wěn)定光信號輸出有助于保持蛋白質(zhì)檢測的一致性和靈敏度。



磷酸化位點(diǎn)鑒定實驗服務(wù)-輝駿生物


磷酸化是細(xì)胞信號通路中重要的共價翻譯后修飾 (PTM)。 這種修飾是一個可逆過程,由蛋白激酶催化。 研究表明,超過 30% 的真核蛋白質(zhì)會發(fā)生磷酸化。 磷酸化修飾對靶蛋白主要有兩種調(diào)控機(jī)制:(1)磷酸化可能引起修飾蛋白如酶、受體等結(jié)構(gòu)的構(gòu)象變化,從而“開啟”或“關(guān)閉”功能。 (2) 磷酸化改變了蛋白質(zhì)對其效應(yīng)子的親和力,通過這樣做,磷酸化的蛋白質(zhì)可以募集或釋放其下游效應(yīng)子。 因此,可以想象磷酸化修飾調(diào)節(jié)廣泛的生物活動,例如細(xì)胞生長、細(xì)胞代謝、細(xì)胞分裂等。 


磷酸化可能發(fā)生在真核生物中的絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸和組氨酸殘基上。 在這四種類型的磷酸化中,酪氨酸磷酸化是最罕見的,但非常關(guān)鍵。 最著名的酪氨酸激酶受體位于 MAPK 通路的最上游,調(diào)節(jié) Ras 和其他激酶,啟動磷酸化級聯(lián)反應(yīng)。


通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)結(jié)合數(shù)據(jù)庫檢索,可以對目前已知的各種蛋白修飾類型(如磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化、琥珀?;龋┖鸵恍┬》肿铀幬镌诘鞍咨系男揎椢稽c(diǎn)進(jìn)行鑒定。


輝駿生物-蛋白磷酸化分析服務(wù)實驗流程

1. 在凝膠或溶液中消化蛋白質(zhì)(取決于您發(fā)送給我們的樣品類型)

2. 磷肽的濃度(可選;取決于磷肽的豐度)

3. HPLC 分離,然后進(jìn)行 MALDI-TOF MS/MS 分析

4. 質(zhì)譜數(shù)據(jù)解釋


lc-ms/ms修飾位點(diǎn)鑒定技術(shù)服務(wù)—輝駿生物優(yōu)勢

1
不需要對修飾進(jìn)行富集,可同時檢測多種修飾類型


2
項目周期短



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