在非靶向代謝組學方法中，在一個樣本中研究了數千種代謝物。然而，該化合物的化學特性在靶向方法中并不為人所知。在研究期間或研究完成后獲取有關化合物的數據，這些信息用于注釋或確定代謝物。

為了最大限度地解釋樣品及其影響，以非靶向方法進行穩(wěn)健的化合物鑒定。  通過可靠的識別或注釋，可以對單個研究進行生物數據解釋，并且可以比較來自不同研究組的數據。

代謝物注釋和鑒定標準

代謝組學標準倡議 (MSI) 和代謝組學報告核心信息 (CIMR) 的化學分析工作組 (CAWG) 將代謝物分為四類。  他們是：

★ 1 級：已鑒定的代謝物

★ 級別 2：假定注釋的化合物

★ 第 3 級：假定表征的復合類別

★ 4級：未知化合物

研究人員在報告代謝物時需要清楚地區(qū)分和確定水平。 大多數已被鑒定、表征和報道的代謝物都是非新的。  第一次未識別的代謝物將根據與可靠樣品的共同表征進行識別。  提供了已確定的 1 級非新型化合物的最低報告標準。無法在商業(yè)上獲得的代謝物被確定為推定的注釋化合物（2 級）。  這些代謝物沒有化學參考標準；  然而，它們是根據與光譜數據庫一致的物理化學特性來識別的。在光譜和化學數據庫中，沒有為鑒定為假定特征化合物類別（3 級）的代謝物提出結構。  這些化合物的識別取決于給定化學類別化合物的獨特物理化學相似性或光譜特性。

當化合物未被識別或分類時，它們被稱為未知化合物（4 級），但可以根據可用的光譜數據進行區(qū)分和計算。

代謝物的命名

CAWG 支持識別新型代謝物的傳統原則，并建議研究人員按照國際純粹與應用化學聯合會 (IUPAC) 命名法命名該化合物。

對于非新型代謝物，IUPAC 提供了化合物分類的標準。  由于這些名稱冗長且最復雜，因此它們被替換為短名稱和常用名稱。

下面提到的數字標識符可用于引用化合物。

★ IUPAC 國際化學品標識符 (InChI)

★ 具有生物意義的化學實體 (ChEBI)

★ 簡化分子輸入線輸入規(guī)范 (SMILES)

★ 化學文摘社 (CAS)

★ PubChem 化合物標識符 (CID)

★ 摩爾文件

CAS 編號的專有屬性使其不太受歡迎。通常首選 InChI、CID 和 SMILES 代碼。CAWG 建議使用 InChI 代碼，因為它們便于數據交換和與數據庫通信，并建議研究人員至少報告一個 IUPAC 化學名稱或任何通用名稱以及已識別的代謝物的結構代碼，以便公開它們。

對于未鑒定的代謝物，建立了報告它們的最低標準。  例如，對于所有未知的化合物，殺蟲劑或除草劑需要與內源性代謝物徹底區(qū)分開來。

主要舉措

有許多重要的倡議和團體致力于進一步開發(fā)和應用這些標準。

★ MetaboLights 是第一個滿足 MSI 報告元數據標準的通用公共代謝組學存儲庫。  作者可以報告化合物的正確預期名稱，并將其映射到可用的代謝物數據庫，例如 ChEBI，并且還定義了置信水平。  分析元數據有助于跟蹤未知的化合物。

★ METLIN 是一個精選數據庫，提供多種搜索功能，包括對未知化合物表征的相似性搜索。

★ isoMETLIN 代謝物數據庫旨在用于基于同位素的代謝組學。  可以使用 isoMETLIN 識別包含同位素標記的代謝物。  在 isoMETLIN 的幫助下，用戶可以搜索來自 METLIN 數據庫的超過 100 萬個計算得到的同位素體。  根據 13C 或 15N 等特定同位素和質荷比值，進行搜索。

★ 代謝組學標準協調 (COSMOS) 協助整個歐盟的數據提供者建立和推廣標準，以便更輕松地分發(fā)代謝組學數據。

★ Metabolomics Workbench 有助于更新可用的標準并創(chuàng)建代謝組學中缺少的標準。

★ 代謝組學學會發(fā)起了代謝物鑒定任務組和數據標準，以確保標準不斷發(fā)展以滿足未來的要求。  該協會的目標是在參與標準制定的人員和其他利益相關者之間提供有效的溝通和協調。  代謝物鑒定工作組的作用是讓社區(qū)成員參與有關使用報告標準來鑒定化合物的活動。

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