您是否對(duì)免疫沉淀CoIP和免疫共沉淀IP之間的差異感到困惑?這兩種技術(shù)表面上看起來(lái)很相似,但它們?cè)趹?yīng)用和實(shí)驗(yàn)設(shè)置上存在分歧。免疫沉淀涉及從樣品中分離靶蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)的混合物。它利用抗體來(lái)固定特定的蛋白質(zhì)。另一方面,免疫共沉淀使研究人員能夠識(shí)別和表征蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用,使其更上一層樓。這項(xiàng)技術(shù)旨在從復(fù)雜的混合物中挖掘出目標(biāo)蛋白及其伙伴蛋白,為它們的整合功能提供重要的見(jiàn)解??傊m然免疫沉淀分離特定的感興趣的蛋白質(zhì),但免疫共沉淀深入研究樣品內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用的動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)。
免疫沉淀和免疫共沉淀之間的二分法植根于實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的細(xì)節(jié)。免疫沉淀需要明智地使用特異性抗體以從蛋白質(zhì)的復(fù)雜混合物中提取目標(biāo)蛋白質(zhì)。最重要的抗體鎖存到所需的蛋白質(zhì)上,產(chǎn)生有趣的抗原-抗體復(fù)合物的形成,然后使其沉淀,通常利用蛋白質(zhì)A/G珠或類似的技術(shù)。這一多方面的魔法在其確保目標(biāo)蛋白質(zhì)的純化和濃縮以用于下游分析的能力方面是無(wú)與倫比的。
在這個(gè)復(fù)雜的硬幣的另一面是免疫共沉淀。這種方法將感興趣的蛋白質(zhì)及其相互作用的伴侶一起并以一定的技巧拋到聚光燈下。為了實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn),抗體(當(dāng)然)被部署,其全神貫注地專注于感興趣的蛋白質(zhì)。這種大膽的方法旨在捕獲感興趣的蛋白質(zhì)及其靈巧的隨從時(shí),研究它們?cè)趶?fù)合物中的相互作用。這種復(fù)雜的生物學(xué)作用網(wǎng)絡(luò)需要尖端技術(shù),而免疫共沉淀是最有效的方法之一。
IP免疫沉淀的科學(xué)技術(shù)是一種高度有效的方法,主要用于從復(fù)雜混合物中分離和純化特定的感興趣蛋白質(zhì)。這種廣泛使用的方法提供了大量有價(jià)值的見(jiàn)解蛋白質(zhì)研究的不同方面,如蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),功能,翻譯后修飾,和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的相互作用。通過(guò)使用免疫沉淀作為工具,研究人員可以研究特定蛋白質(zhì)在給定樣品中的存在和分布,以及其生化特性。
然而,對(duì)于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的研究,通常采用稱為免疫共沉淀的更先進(jìn)和復(fù)雜的方法。該技術(shù)專門設(shè)計(jì)用于鑒定和分離與靶蛋白相互作用的蛋白質(zhì),提供對(duì)復(fù)合物內(nèi)蛋白質(zhì)的功能關(guān)系、動(dòng)力學(xué)和組成的核心見(jiàn)解。此外,從co-IP收集的信息對(duì)于分析信號(hào)通路、研究蛋白質(zhì)復(fù)合物以及探索與蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)的復(fù)雜生物過(guò)程是非常寶貴的。因此,免疫共沉淀是蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域中的重要工具,提供了對(duì)生物過(guò)程的潛在機(jī)制和復(fù)雜性的更好的理解。
在免疫沉淀的復(fù)雜世界中,靶蛋白的選擇是決定研究成敗的關(guān)鍵步驟。它需要科學(xué)悟性、戰(zhàn)略思維以及對(duì)所研究蛋白質(zhì)生物學(xué)功能的深刻理解相結(jié)合。通常,研究人員會(huì)仔細(xì)研究大量數(shù)據(jù),尋找蛋白質(zhì)相互作用的線索,與研究問(wèn)題的相關(guān)性,以及其他特定標(biāo)準(zhǔn),以確保分離出感興趣的單個(gè)蛋白質(zhì)。
但對(duì)知識(shí)的追求并不止于此。進(jìn)入免疫共沉淀co-ip,一種將目標(biāo)選擇提升到一個(gè)全新的水平的技術(shù)。這種方法將焦點(diǎn)擴(kuò)展到單個(gè)蛋白質(zhì)之外,鼓勵(lì)對(duì)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用進(jìn)行更廣泛的研究,這些相互作用對(duì)我們理解復(fù)雜生物系統(tǒng)至關(guān)重要。通過(guò)捕獲靶蛋白及其相互作用的伴侶,研究人員可以更深入地研究這些關(guān)系的錯(cuò)綜復(fù)雜,并揭示構(gòu)成這個(gè)非凡網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜組成部分。
IP和COIP之后可以進(jìn)行各種下游分析,例如蛋白質(zhì)印跡、質(zhì)譜或功能測(cè)定。然而,下游分析的選擇可能取決于實(shí)驗(yàn)的具體目標(biāo)而不同。免疫沉淀之后通常是如蛋白質(zhì)印跡的技術(shù)以驗(yàn)證靶蛋白的存在和純度。它也可以用于蛋白質(zhì)定量或檢測(cè)特定的翻譯后修飾。另一方面,免疫共沉淀經(jīng)常與質(zhì)譜等技術(shù)結(jié)合,以鑒定蛋白質(zhì)復(fù)合物內(nèi)的相互作用伴侶。這種方法提供了一個(gè)更廣泛的觀點(diǎn),蛋白質(zhì)相互作用,并允許復(fù)雜的組合物和動(dòng)力學(xué)的表征。
總之,免疫沉淀和免疫共沉淀是蛋白質(zhì)研究中有價(jià)值的技術(shù),但它們?cè)趯?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、應(yīng)用、靶點(diǎn)選擇和下游分析方面有所不同。免疫沉淀主要集中在特定蛋白質(zhì)的分離和純化,而免疫共沉淀的目的是捕獲蛋白質(zhì)復(fù)合物并研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。了解這些技術(shù)之間的差異可以讓研究人員根據(jù)他們的研究目標(biāo)和實(shí)驗(yàn)需求選擇最合適的方法。
內(nèi)源蛋白抗體免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)步驟
標(biāo)簽抗體免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)流程
1. Co-IP WB,用于檢測(cè)某樣本中的誘餌蛋白和待測(cè)蛋白是否存在相互作用;
2. Co-IP MS,用于篩選某樣本中的誘餌蛋白與哪些蛋白具有相互作用。
服務(wù)項(xiàng)目 | 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實(shí)驗(yàn)周期 | 客戶提供 | 價(jià)格 |
(驗(yàn)證型) | 樣本中誘餌蛋白和待測(cè)蛋白的Western blot檢測(cè) | Western blot檢測(cè)圖 | 4-5周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 待測(cè)蛋白抗體 實(shí)驗(yàn)信息表 | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | CoIP實(shí)驗(yàn)報(bào)告 誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖 待測(cè)蛋白Western blot檢測(cè)圖 | ||||
(篩選型) | 樣本中誘餌蛋白的Western blot檢測(cè) | Western blot檢測(cè)圖 | 7-8周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 實(shí)驗(yàn)信息表 | |
Co-IP調(diào)取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實(shí)驗(yàn)組、對(duì)照組) | CoIP實(shí)驗(yàn)服務(wù)報(bào)告 誘餌蛋白Western blot檢測(cè)圖 | ||||
LC-MS/MS檢測(cè)及數(shù)據(jù)分析 | 質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果及報(bào) 告互作蛋白篩選表格 生物信息學(xué)分析結(jié)果和報(bào)告 |
Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP.
Cancer Research. 2019. (中科院1區(qū),IF=13.312).
轉(zhuǎn)移性前列腺癌具有很高的致命性。已有報(bào)道表明,膽固醇與前列腺癌的發(fā)展有關(guān);前期研究發(fā)現(xiàn),膽固醇可以誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),但其作用及潛在機(jī)制尚不清楚。本研究證明膽固醇介導(dǎo)APMAP上調(diào),APMAP通過(guò)與EGFR競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合EPS15R,進(jìn)而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞EMT;提出APMAP可能是一種關(guān)鍵的調(diào)節(jié)劑,為高脂肪飲食、肥胖和癌癥轉(zhuǎn)移之間提供了聯(lián)系。
1. Li H.B. et al: The plant ESCRT component FREE1 shuttles to the nucleus to attenuate abscisic acid signaling. Nature Plants. 2019,IF=17.352. |
2.
Jiang, S. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal
Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR
through APMAP. Cancer Research.2019,IF= 13.312. |
3. Huang C.Y. et al: UBAP2L arginine methylation by PRMT1 modulates stress granule assembly. Cell Death Differ. 2020 , IF=12.067. |
1. 近十年服務(wù)經(jīng)驗(yàn),服務(wù)客戶眾多,案例發(fā)表在Nature Cell Biology、Nature Plants、Cancer Research等知名期刊上。
2. 對(duì)蛋白互作的篩選鑒定理解深刻,擅長(zhǎng)針對(duì)客戶具體情況提出合適的方案建議。
3. 自有分子及細(xì)胞生物實(shí)驗(yàn)平臺(tái),能有效制定并執(zhí)行最優(yōu)的實(shí)驗(yàn)路線。
4. 自有蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái),對(duì)微量CoIP實(shí)驗(yàn)產(chǎn)物的質(zhì)譜鑒定有十足的把控能力,對(duì)后續(xù)的生物信息分析有獨(dú)到的見(jiàn)解。
5. 售后技術(shù)支持將一直保持到客戶發(fā)表文章,確保客戶安心免疫共沉淀下游實(shí)驗(yàn)及投稿。
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