iTRAQ 定量蛋白質(zhì)分析的基本原理是在末端氨基和賴氨酸側(cè)將具有共價(jià)鍵的標(biāo)記肽與 iTRAQ 試劑結(jié)合,通過高效液相色譜、初級質(zhì)譜和二級質(zhì)譜分離后,可以對樣品中的蛋白質(zhì)進(jìn)行表征和相對定量。
iTRAQ 分析適用于廣泛的樣品來源,幾乎所有收集的樣品都可以在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中使用該技術(shù)進(jìn)行篩選。 無論是尋找功能性蛋白質(zhì)、機(jī)理探索,還是篩選疾病生物標(biāo)志物,iTRAQ 定量蛋白質(zhì)組學(xué)都能以最便捷的方式將樣本轉(zhuǎn)化為研究結(jié)果。
理論上,iTRAQ 分析 需要每個樣品至少 300 μg 的蛋白質(zhì)才能達(dá)到通常低于 100% 的成功實(shí)驗(yàn)率。 因此,理想情況下,每次實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備的蛋白質(zhì)量應(yīng)足以進(jìn)行兩次獨(dú)立實(shí)驗(yàn)。 此外,收集的樣本可能并不總是滿足調(diào)查的需要。 因此,需要對選定的樣本以及如何充分處理它們給予更多的思考。
樣本種類繁多,包括組織、細(xì)胞、血液(血清或血漿)、腦脊液、尿液、骨骼、關(guān)節(jié)滑液等,不同樣本的采集方法也不同。 一般來說,需要滿足以下幾點(diǎn):
1.代表性樣品 :
樣品的代表性直接關(guān)系到檢測結(jié)果的科學(xué)意義;
因此,需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康淖屑?xì)選擇抽樣方案。 實(shí)驗(yàn)樣品和對照之間不應(yīng)有污染。
如果可用,來自實(shí)驗(yàn)組和對照組的樣品應(yīng)在采樣時間、地點(diǎn)和處理?xiàng)l件方面保持一致。 否則,可能會影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的整體可信度。
體液樣本需要通過逐步離心(或膜)去除干擾因素,包括但不限于細(xì)胞、細(xì)胞碎片和細(xì)菌。
不同樣本來源的蛋白質(zhì)組是多種多樣的,甚至同一組織樣本的不同細(xì)胞也可以有顯著差異; 因此,量化兩個可能不相關(guān)的樣本是不可比的。
因此,在設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)以制備樣品時,考慮生物實(shí)驗(yàn)中的單變量原理非常重要。
2.樣品準(zhǔn)確性 :
必須準(zhǔn)確記錄各種代表性樣品的數(shù)據(jù)。 所有樣品必須按要求(低溫和即時)收集、制備、儲存和運(yùn)輸,從而根據(jù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)獲得最終數(shù)據(jù)。
3.樣品時效性 :
樣品質(zhì)量是影響各類測試實(shí)驗(yàn)中實(shí)驗(yàn)結(jié)果的關(guān)鍵因素。 用于研究的樣品應(yīng)立即收集、制備、儲存和運(yùn)輸,以盡量減少實(shí)驗(yàn)的樣品收集時間。 應(yīng)特別注意易降解的樣本,例如胰腺; 以及易受微生物污染的樣品,例如尿液。
4.低溫處理 :
樣品采集、標(biāo)記、記錄后,立即用液氮速凍,-80℃保存。 不要太相信 -80°C 冰箱。 一般建議蛋白質(zhì)組學(xué)研究的樣品保存時間不要超過一年,長期保存的樣品在使用前需要進(jìn)行定性檢查以確定穩(wěn)定性。
輝駿生物建議您在取樣時同時保留和備份樣品,以防止部分降解和延遲重新取樣。 即使所有樣品都合格,備份樣品也可以用于實(shí)驗(yàn)的不同方面(例如,定量驗(yàn)證、蛋白質(zhì)方面、生化方面等)。
iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)實(shí)驗(yàn)*輝駿服務(wù)優(yōu)勢
1
十年服務(wù)經(jīng)驗(yàn),客戶成果發(fā)表在NatureMethods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。
2
對蛋白篩選與定量方面有獨(dú)到見解,擅長針對客戶情況提出合適的方案建議。
3
自有分子及細(xì)胞生物實(shí)驗(yàn)平臺,能有效制定并執(zhí)行最優(yōu)的實(shí)驗(yàn)路線。
4
售后技術(shù)支持將一直保持到客戶發(fā)表文章,確保客戶安心進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn)及投稿。
iTRAQ實(shí)驗(yàn)服務(wù)信息
項(xiàng)目名稱 | 客戶提供 | 結(jié)果交付 | 實(shí)驗(yàn)周期 | 價(jià)格 |
原始樣本(干冰運(yùn)輸,廣州地區(qū)可上門取樣) 樣本信息表 分析要求 | 1、蛋白鑒定及定量結(jié)果表 | 5-7周 |
1. Li K. et al: Tyrosine kinase Fyn promotes osteoarthritis by activating the β-catenin pathway. Ann Rheum Dis. 2018,IF=14.299. |
2.
Wu X.S. et al: Ubiquitin-specific protease 3 promotes cell migration
and invasion by interacting with and deubiquitinating SUZ12 in gastric
cancer. J Exp Clin Cancer Res. 2019,IF= 7.068. |
3.
Xiao Y.Y. et al: A comprehensive investigation of starch degradation
process and identification of a transcriptional activator MabHLH6 during
banana fruit ripening. Plant Biotechnol J. 2018,IF=6.84. |
4. Zeng L. et al: Asparagine Synthetase and Filamin A Have Different Roles in Ovarian Cancer. Front Oncol. 2019,IF=4.848. |
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