標(biāo)題:Inhibition of long noncoding RNA Linc-Pint by hepatitis C virus in infected hepatocytes enhances lipogenesis.
期刊:Hepatology
影響因子:14.971
關(guān)鍵詞:HCV,lncRNA,Linc-Pint,PRC2,SRPK2,F(xiàn)ASN,脂肪生成
主要技術(shù)方法:RNA pull down,質(zhì)譜鑒定(LC-MS/MS),RNA免疫共沉淀(RIP)等
丙型肝炎病毒(HCV)經(jīng)是引起丙型肝炎的病原體,屬于RNA病毒。HCV編碼的幾個因子可以損害宿主基因,實現(xiàn)慢性感染,通常導(dǎo)致肝硬化或肝細(xì)胞癌(HCC)。長鏈非編碼RNA(LncRNA)在生物調(diào)節(jié)中顯示出不同的作用,而其在HCV病毒復(fù)制和相關(guān)疾病中的作用還知之甚少。
2020年11月,美國圣路易斯大學(xué)病理系的Mousumi Khatun等人發(fā)現(xiàn)在HCV感染的肝細(xì)胞和肝臟樣本中,Linc-Pint顯著下調(diào)。從機制上講,Linc-Pint可以結(jié)合并下調(diào)絲氨酸/精氨酸蛋白特異性激酶2 (SRPK2)的蛋白水平,進(jìn)而抑制脂肪生成相關(guān)基因(FASN和ACLY)的表達(dá)。HCV介導(dǎo)的Linc-Pint下調(diào)增強了脂肪生成,有利于病毒復(fù)制和肝病的發(fā)展。
1. Linc-Pint在HCV感染的肝細(xì)胞中下調(diào)且促進(jìn)細(xì)胞增殖
qRT-PCR檢測發(fā)現(xiàn),Linc-Pint在HCV感染的肝細(xì)胞或是慢性HCV感染的人肝活檢標(biāo)本中含量較低。當(dāng)在肝細(xì)胞中過表達(dá)Linc-Pint后,細(xì)胞增殖受到顯著抑制。
2. Linc-Pint結(jié)合SPRK2蛋白并下調(diào)其表達(dá)
據(jù)報道,Linc-Pint由p53轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo),通過與PRC2相互作用,抑制癌細(xì)胞的遷移和侵襲。研究者利用RNA pull-down和質(zhì)譜檢測(LC-MS/MS)技術(shù),發(fā)現(xiàn)在許多腫瘤中高表達(dá)且對腫瘤進(jìn)展和轉(zhuǎn)移有重要作用的SRPK2可能是Linc-Pint的潛在結(jié)合蛋白,并利用RNA pull down WB和RNA免疫共沉淀(RIP-qPCR)技術(shù)驗證了兩者之間的相互作用。RNA pull-down實驗結(jié)果進(jìn)一步確定了Linc-Pint與SRPK2的結(jié)合位點位于其635-904nt之間。
接下來,作者研究了Linc-Pint對SPRK2的影響。當(dāng)在細(xì)胞中過表達(dá)Linc-Pint時, SPRK2蛋白水平下調(diào),而RNA水平?jīng)]有變化,因此接著探討了Linc-Pint是否影響SPRK2蛋白的穩(wěn)定性。Linc-Pint過表達(dá)的細(xì)胞中使用MG132蛋白酶體抑制劑處理后,Linc-Pint對SPRK2蛋白的抑制減弱了,表明Linc-Pint可能通過蛋白酶體的降解在蛋白水平下調(diào)SRPK2的表達(dá)。
3. Linc-Pint通過下調(diào)SRPK2來抑制脂肪合成途徑
據(jù)報道,SRPK2通過磷酸化SR蛋白(富含絲氨酸/精氨酸的蛋白),誘導(dǎo)脂肪合成途徑的不同基因如脂肪酸合成酶(FASN)、ATP檸檬酸裂解酶(ACLY)的有效剪接,導(dǎo)致這些基因在mRNA和蛋白水平的表達(dá)增加。qRT-PCR結(jié)果顯示,Linc-Pint過表達(dá)顯著下調(diào)了肝細(xì)胞中FASN和ACLY的mRNA水平。熒光顯微鏡觀察進(jìn)一步顯示,Linc-Pint通過抑制SRPK2抑制脂肪合成基因的表達(dá)。干擾SRPK2基因后,肝細(xì)胞中FASN和ACLY mRNA的表達(dá)顯著下調(diào),表明SRPK2參與了肝細(xì)胞脂肪合成途徑的調(diào)控。
4. Linc-Pint在HCV感染的肝細(xì)胞中的作用
已有報道指出HCV感染誘導(dǎo)了肝細(xì)胞中的脂肪從頭合成途徑,因此我們猜測Linc-Pint是否通過抑制肝細(xì)胞脂肪合成途徑來抑制HCV復(fù)制。結(jié)果發(fā)現(xiàn),HCV感染后促進(jìn)了SRPK2和FASN的表達(dá),而當(dāng)同時過表達(dá)Linc-Pint時,SRPK2和FASN的表達(dá)被顯著抑制。進(jìn)一步的實驗表明,Linc-Pint的過表達(dá)抑制了SRPK2激酶的活性。那么Linc-Pint過表達(dá)是否影響HCV的復(fù)制呢?qPCR結(jié)果表明Linc-Pint過表達(dá)抑制了HCV的復(fù)制;干擾SRPK2后,HCV的復(fù)制受到抑制。
本研究有助于從機制上理解Linc-Pint在HCV相關(guān)的肝臟發(fā)病機制中的作用。
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