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1. 從純化方式來看：采用ProteinA/G純化的多抗摻雜有動物本身產生的對其自身抗原產生的抗體，這些抗體在檢測中會識別樣本中的蛋白而出現雜帶，可采用抗原親和純化避免雜帶的產生。
2. 從蛋白修飾來看：天然蛋白存在復雜的翻譯后修飾。這點可以通過信息學分析進行解釋。
3. 從蛋白翻譯后加工來看：翻譯后蛋白前體經切割可能會使部分蛋白分子量偏小，而天然組織中同時存在蛋白前體和切割加工后的蛋白，二者序列有相同部分，可能會產生雜帶。這點需要通過查閱與目的蛋白相關文獻進行了解。
4. 從同源家族蛋白來看：當目的蛋白有同源家族蛋白時，蛋白異構體的存在可能會使分子量偏離預測分子量，因為天然樣本中由同一個mRNA不同的剪接方式進行翻譯形成的蛋白產物也會有相同的抗原表位，同時被抗體識別時會產生雜帶。
5. 從蛋白聚集形式來看：蛋白多聚體的形成，雖然還原條件可以抑制多聚體的形成，但是強烈的蛋白間相互作用在還原條件下也有可能不解聚導致條帶偏大。